Kelurahan Cebongan sendiri terdiri dari 6 (enam) Dukuh yang merupakan 6 (enam) RW dan 22 (dua puluh dua) RT dengan rincian sebagai berikut :
a. Dukuh Cebongan
meliputi wilayah RW I terdiri dari RT 01, 02, 03, 04, 05, 06
b. Dukuh Sukosari
meliputi wilayah RW II terdiri dari RT 01, 02, 03
c. Dukuh Isep-Isep
meliputi wilayah RW III terdiri dari RT 01, 02, 03
d. Dukuh Sidoharjo
meliputi wilayah RW IV terdiri dari RT 01, 02, 03, 04
e. Dukuh Jagalan
meliputi wilayah RW V terdiri dari RT 01, 02, 03
f. Dukuh Sukoharjo
meliputi wilayah RW VI terdiri dari RT 01, 02, 03
Adapun data nama Ketua RT-RW di Kelurahan Cebongan yaitu :
| No. | Nama Ketua RT/RW | RT/RW |
| 1 | Eko Hartanto | RW 01 |
| 2 | Safroni | 01 |
| 3 | Sobirin | 02 |
| 4 | Waluyo | 03 |
| 5 | Ngadimin | 04 |
| 6 | Ahmad Iqna Al Fuady | 05 |
| 7 | Sriyono | 06 |
| 8 | Siswanto | RW 02 |
| 9 | Karsono | 01 |
| 10 | Sujati | 02 |
| 11 | Tasmin Nastoto | 03 |
| 12 | Taslichan | RW 03 |
| 13 | Muhtadi | 01 |
| 14 | Tasin Rifai | 02 |
| 15 | Drs.Suwarna | 03 |
| 16 | Margana | RW 04 |
| 17 | Sutopo | 01 |
| 18 | Basri | 02 |
| 19 | Catur Yoga Waluyo | 03 |
| 20 | Nashif ‘Ubbadah | 04 |
| 21 | Bastoni | RW 05 |
| 22 | Rukimin | 01 |
| 23 | Muhammad Solikhudin | 02 |
| 24 | Mulyono | 03 |
| 25 | Sunaryo | RW 06 |
| 26 | Jony Tri Haryanto | 01 |
| 27 | Sunarman | 02 |
| 28 | Budi Mulyono | 03 |