Sejarah nama “Cebongan” berasal dari cerita bahwasanya ada sebuah desa bernama Banyuroto yang kondisi wilayahnya dikelilingi sungai-sungai. Sungai-sungai tersebut pada saat musim kemarau mengalami surut dan menjadi sarang katak untuk bertelur. Telur katak tersebut kemudian menetas menjadi anak katak (cebong) dalam jumlah yang sangat banyak. Karena banyaknya cebong yang mengelilingi sungai di Banyuroto, maka Banyuroto sering kali disebut “cebongan”. Lambat laun Banyuroto berubah nama menjadi Cebongan.
Berdasarkan Peraturan Pemerintah Republik Indonesia Nomor 69 Tahun 1992 tentang Perubahan Batas Wilayah Kotamadya Daerah Tingkat II Salatiga dan Kabupaten Daerah Tingkat II Semarang, wilayah Desa Cebongan masuk ke dalam Pemerintahan Kotamadya Salatiga (Pemekaran Tahun 1992). Desa Cebongan kemudian beralih status menjadi Kelurahan Cebongan berdasarkan Peraturan Daerah Kota Salatiga Nomor 11 Tahun 2003 tentang Perubahan Status Desa menjadi Kelurahan. Sekarang Kelurahan Cebongan masuk dalam wilayah Kecamatan Argomulyo Kota Salatiga. Kantor Lurah Cebongan berada di Jalan Soekarno-Hatta Nomor 32 Kota Salatiga.
Dalam perkembangannya dari Desa menjadi Kelurahan, Cebongan telah dipimpin oleh beberapa Kepala Desa/ Lurah. Kepala Desa memimpin berdasarkan hasil pilihan langsung dari rakyat melalui Pemilihan Kepala Desa (Pilkades), sedangkan Lurah merupakan PNS yang diangkat dalam jabatan melalui pelantikan oleh Walikota Salatiga. Adapun data Kepala Desa/ Lurah Cebongan selengkapnya adalah sebagai berikut :
| No. | Nama | Jabatan | Periode |
| 1 | H. Ibrahim | Kepala Desa | 1874 – 1890 |
| 2 | H. Sastro Tinojo | Kepala Desa | 1890- 1931 |
| 3 | Dawoed | Kepala Desa | 1931 – 1931 |
| 4 | Dirdjo | Kepala Desa | 1931 – 1934 |
| 5 | Pawiro Soemarto | Kepala Desa | 1934 – 1961 |
| 6 | H. A. Goenadi Djojo Martono | Kepala Desa | 1962 – 1988 |
| 7 | H. Soewarno | Kepala Desa | 1988 – 1998 |
| 8 | Drs. Sururi | Kepala Desa | 1998 – 2003 |
| 9 | Suwarno, SE | Lurah | 2003 – 2006 |
| 10 | Sugeng Wahyono, SE | Lurah | 2006 – 2007 |
| 11 | A’an Trisyadi, SH, MH | Lurah | 2007 – 2012 |
| 12 | Drs. H. Sururi | Lurah | 2012 – sekarang |
Kode wilayah Kelurahan Cebongan adalah 3373031006 dengan tipologi perladangan, jasa dan perdagangan. Kondisi wilayahnya berada diluar ibukota Kecamatan dan bukan merupakan daerah rawan bencana. Orbitasi Kelurahan Cebongan dari pusat Kota Salatiga kurang dari 1 (satu) jam.
(Red/Kel.Cebongan)